マイケル・J・ベーエ(Michael J. Behe、1952年 - )はアメリカ合衆国の生化学者、インテリジェント・デザイン支持者。マイケル・ビーヒーと訳されたこともある。
リーハイ大学の教授で、インテリジェント・デザイン運動を主導するディスカバリー・インスティチュートの「科学と文化センター」シニア研究員である。彼は生化学レベルでは進化の結果としては十分説明できないほど複雑な構造が存在すると言う概念を「還元不能な複雑さ(Irreducible complexity)」と呼び、進化への反証であると主張している。彼の細胞構造の還元不能な複雑さの主張は科学界で激しく議論された。リーハイ大学の生物科学部は次のように公式な立場を表明した。「インテリジェント・デザインは科学を基盤としておらず、実験的に検証されておらず、科学であると考えられてはならないというのが我々の総意である」。ベーエのインテリジェント・デザイン(以下ID)についての主張はニセ科学として科学界から拒否された 。ベーエはペンシルベニア州ドーバー学区で2005年に行われた進化論裁判で被告側(ID側)の専門家として証言台に立ち、彼の証言は裁判官によって「科学ではなく本質的に宗教である」と指摘された。
既婚者で、9人の子どもがいる。
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